冷藏集装箱是一种带有制冷设备的，能把具有必症温度的货品，保持在该温度下进行运输的绝热集装箱。一般在装箱前要求对货品进行预令，使货品温度降低到给定温度以下，然后装箱。要求对冷藏集装箱的制冷温度，是否还有其他特别要求进行核验，例如调整空气量、保鲜度等。对冷藏集装箱的內部、外部和底部结构进行检查，检查其是否有损坏。如果有损坏，将会影响制冷或保温效果。还要确认冷藏集装箱的箱型。一般保鲜货品的冷藏温度要求在0℃以上。
在使用冷藏集装箱租赁运输的时候安全稳定性是非常重要的，由于冷藏集装箱往往比较重，是人力所无法抬起的，所以在运羭的过程就需要在起重设备以及其他的运输装备上满足要求。也正是因为它的重量，往往会导致运输设备在重心上的不稳定，所以在边边角角上的防护包装就十分必要，以此避免集装箱受到刮擦，导致变形的情况。除了要保证冷藏集装箱的平稳，而且对于人员来说在吊装运的时候要远离，不要站在下面，以防意外的发生。
冷藏集装箱装货后应检查冷藏或冷冻货的原有质量，并在货单上加以说明。在装箱过程中，应严格装货堆码原则，避免冷风短路造成降温不平衡，降低制冷装置的制冷效率。长距离运输时，箱内设定温度与实际温度差不能过大。运送新鲜水果、蔬菜等，应及时打开通风口，进行通风换气。
